Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms