Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms