Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms