Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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