Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms