Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3C2AO00443 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms