Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms