Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QRK9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QRK9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QRK9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QRK9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms