Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf98E9PRG8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf98E9PRG8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf98E9PRG8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf98E9PRG8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms