Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms