Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms