Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC144AA2RUR9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms