Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms