Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms