Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SH3BP1Q9Y3L3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SH3BP1Q9Y3L3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SH3BP1Q9Y3L3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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