Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms