Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms