Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms