Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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