Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms