Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms