Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms