Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms