Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms