Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS2Q9NRF8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms