Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms