Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms