Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms