Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms