Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPAS1Q99742 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms