Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms