Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAP1L3Q99457 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms