Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCT8L2Q96SF2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms