Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms