Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms