Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms