Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPNS2Q96L46 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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