Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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