Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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