Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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