Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms