Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms