Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms