Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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