Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms