Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms