Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C17orf47Q8NEP4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C17orf47Q8NEP4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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C17orf47Q8NEP4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C17orf47Q8NEP4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C17orf47Q8NEP4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C17orf47Q8NEP4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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C17orf47Q8NEP4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C17orf47Q8NEP4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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