Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms