Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms