Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMER3Q8N944 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms